Mokyklos metodinę veiklą organizuoja metodinė taryba. Ją sudaro metodinės tarybos pirmininkas ir metodinių grupių pirmininkai.
Metodinės tarybos pirmininkė – direktoriaus pavaduotoja ugdymui Birutė Liepuonienė.
Metodinės grupės ir pirmininkai:
Kalbų, socialinio ir dorinio ugdymo metodinė grupė – Jurgita Barasienė;
Matematikos, informacinių technologijų ir gamtamokslinio ugdymo grupė – Aurelija Šiaučiūnienė;
Meninio, dorinio, technologijų ir fizinio ugdymo grupė – Andželika Pluščiauskienė;
Jūreivystės, laivybos ir karybos ugdymo grupė – Arvydas Piepalius;
Pagalbos mokiniui specialistų metodinėsgrupės – Inga Tamašauskaitė.
