Mokyklos metodinę veiklą organizuoja metodinė taryba. Ją sudaro metodinės tarybos pirmininkas ir metodinių grupių pirmininkai.
Metodinės tarybos pirmininkė – direktoriaus pavaduotoja ugdymui Eglė Liaučienė.
Metodinės grupės ir pirmininkai:
Kalbų, socialinio ir dorinio ugdymo metodinė grupė – Jurgita Barasienė.
Matematikos, informacinių technologijų ir gamtamokslinio ugdymo – Aurelija Šiaučiūnienė.
Meninio, technologijų ir fizinio ugdymo – Inesa Žurauskaitė.
Jūreivystės, laivybos ir karybos ugdymo – Raimondas Praleika.
